Un paciente infectado con VIH que presenta disfagia y candidiasis oral tiene una alta probabilidad de tener candidiasis esofágica y debe ser tratado empíricamente. Sin embargo, aproximadamente el 20% de estos pacientes que presentan candidiasis esofágica no tendrán evidencia de candidiasis oral. La odinofagia focal hace que la candidiasis esofágica sea menos probable, siendo la esofagitis ulcerosa la causa más probable. Las causas de las úlceras esofágicas incluyen el virus del herpes simple, el CMV y la esofagitis aftosa. La falta de respuesta a la terapia antimicótica empírica es una indicación para el diagnóstico mediante endoscopia.