Un paciente infectado con VIH que presenta disfagia y candidiasis oral tiene una alta probabilidad de tener candidiasis esofágica y debe ser tratado empíricamente. Sin embargo, aproximadamente el 20% de estos pacientes que presentan candidiasis esofágica no tendrán evidencia de candidiasis oral. La odinofagia focal hace que la candidiasis esofágica sea menos probable, siendo la esofagitis ulcerosa la causa más probable. Las causas de las úlceras esofágicas incluyen el virus del herpes simple, el CMV y la esofagitis aftosa. La falta de respuesta a la terapia antimicótica empírica es una indicación para el diagnóstico mediante endoscopia.

 La histoplasmosis diseminada es más común en pacientes con SIDA que en huéspedes inmunocompetentes. Las características incluyen fiebre, anorexia, pérdida de peso, hepatoesplenomegalia, pancitopenia y sepsis. El examen de médula ósea tiene un rendimiento diagnóstico significativo para aislar Histoplasmosis capsulatum y debe realizarse temprano en la evaluación de la histoplasmosis diseminada. Otros ensayos utilizados para detectar la presencia de este hongo son el polisacárido de H. capsulatum en suero y orina.

 La diarrea sanguinolenta no es una característica clínica del MAC diseminado (complejo Mycobacterium Avium) en pacientes con SIDA. La diarrea acuosa es más común.

 La causa infecciosa más común de abdomen agudo en un paciente con SIDA y un recuento de CD4 inferior a 50 células/ml es la colitis por CMV.

 El neumotórax espontáneo en un paciente infectado por VIH es causado por PCP hasta que se demuestre lo contrario, y se debe iniciar un tratamiento empírico

 Un paciente infectado con VIH que tiene un recuento de CD4 inferior a 200 células/ml que presenta disnea de esfuerzo e infiltrados intersticiales en la radiografía de tórax tiene menos probabilidades de tener PCP si la lactato deshidrogenasa (LDH) es NORMAL. La LDH es un marcador sensible, pero no específico, para la PCP.

 La PCP en un paciente infectado con VIH que recibe profilaxis con pentamidina en aerosol tiene predilección por los ápices pulmonares y los sitios extrapulmonares. Estas son presentaciones poco comunes de la PCP clásica que afecta predominantemente las zonas y bases perihiliares.