Clínicamente, los pacientes con SIDA con leucoencefalopatía multifocal progresiva (LMP) parecen peores que en el estudio de resonancia magnética (IRM) de la cabeza, mientras que la IRM en la demencia asociada al VIH parece peor que el paciente.

 La causa infecciosa más común de megacolon tóxico en pacientes con SIDA que están gravemente inmunodeprimidos es la infección por CMV.

 El síndrome retroviral agudo (infección primaria por VIH) puede presentarse como mononucleosis. Dos características que hacen que el VIH sea un culpable más probable que el VEB, la causa más común de mononucleosis, son una erupción morbiliforme en la cara y el tronco en ausencia de terapia con ampicilina y úlceras orales. Las pruebas de diagnóstico preferidas son la serología del VIH más la PCR cuantitativa del ARN del VIH (carga viral).

 El paciente infectado con VIH que acude a urgencias con taquipnea, disnea, dolor abdominal y acidosis metabólica con brecha aniónica debe someterse a una prueba para detectar acidosis metabólica inducida por análogos de nucleósidos. Las anomalías de laboratorio incluyen niveles bajos de bicarbonato sérico, niveles elevados de lactato sérico, niveles elevados de aminotransferasas y niveles elevados de creatina quinasa. La tomografía computarizada abdominal suele mostrar infiltración grasa en el hígado. Se cree que este síndrome es resultado de toxicidad mitocondrial. Se han reportado casos de presentación simultánea de pancreatitis inducida por nucleósidos y acidosis láctica en pacientes con SIDA.

 Se debe considerar la presencia de MAC diseminado en cualquier paciente febril con un recuento de CD4 inferior a 50 células/ml. El paciente también puede presentar dolor abdominal, pérdida de peso, anorexia y diarrea acuosa. La tomografia computarizada abdominal (SCART) puede mostrar hepatoesplenomegalia y adenopatía mesentérica. La terapia empírica rara vez es necesaria. El diagnóstico se realiza de forma definitiva mediante hemocultivos micobacterianos positivos.

 Se debe sospechar polirradiculopatía por CMV en pacientes con un recuento de CD4 inferior a 50 células/ml que presentan debilidad progresiva de las extremidades inferiores, disminución de los reflejos de las extremidades inferiores, retención urinaria y engrosamiento de la cola de caballo que se demuestra en las imágenes de la médula espinal. Una punción lumbar generalmente demuestra una pleocitosis polimorfonuclear pronunciada y una PCR positiva para CMV.

 El linfoma no Hodgkin (LNH) sistémico en un paciente infectado con VIH no suele presentarse con linfadenopatía superficial generalizada, sino como enfermedad extranodal. El sitio de presentación más común es el tracto gastrointestinal. Aunque es poco común, el LNH puede afectar los pulmones, presentándose con múltiples nódulos pulmonares o infiltrados intersticiales difusos. La mayoría de los casos se asocian con derrames pleurales con o sin afectación parenquimatosa concomitante. Esto es importante clínicamente, ya que puede distinguirse del derrame pleural asociado con el sarcoma de Kaposi, que no se presenta como un derrame aislado, sino como un derrame con una anomalía parenquimatosa adyacente.