Aunque la neumonitis por CMV es una causa grave de morbilidad y mortalidad en pacientes inmunodeprimidos con trasplante de médula ósea, no está tan claro si es una causa de neumonía clínicamente importante en pacientes infectados por el VIH. El diagnóstico de neumonitis por CMV requiere que se cumplan dos condiciones:( a) CMV es el único patógeno recuperado del lavado broncoalveolar y la biopsia transbronquial (es decir, no hay evidencia de infección por PCP) y (b) se observan inclusiones nucleares de CMV (efecto citopático) en la biopsia transbronquial. Un cultivo positivo de CMV del líquido de lavado broncoalveolar indica colonización, pero no es diagnóstica de neumonitis por CMV.